小智（松本梨花 配音）带着皮卡丘（大谷育江 配音），和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上，一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴（钉宫理惠 配音）的少女麦亚丽（中川翔子 配音）。胡巴能够制造出神奇的时空圆环，带领大家在不同的地点来回穿梭。 地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。
演员：卡里·克里斯托弗 艾斯黛拉·马德里加尔 吉姆·加菲根 马莫多·阿西 亚历克斯·罗斯·派瑞 吉亚娜·约瑟夫 菲利普·罗森塔尔 娜塔莎·雷昂 约翰·C·赖利 大卫·洛韦里 梅根·梅兰迪 迈克·梅兰迪
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演员：关智一 雪野五月 野上尤加奈 三木真一郎 根谷美智子 大塚明夫 西村知道 千叶进步 浅野真由美 室园丈裕 福山润 木村郁绘 菊池志穗 高桥美佳子 高桥智秋 半场友惠 松本大 松田佑贵 山岸功 增谷康纪
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